Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX2A6NKB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCNX2A6NKB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCNX2A6NKB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms