Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT1A5YKK6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT1A5YKK6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT1A5YKK6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms