Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTAGE9A4FU28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTAGE9A4FU28 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTAGE9A4FU28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms