Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCRBV5S1A1TA0A578 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV5S1A1TA0A578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms