Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J248

TRAV1-1, T-cell receptor alpha variable 1-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-1A0A0B4J248 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAV1-1A0A0B4J248 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAV1-1A0A0B4J248 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms