Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYVE1Q9Y5Y7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms