Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms