Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHANK2Q9UPX8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms