Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS4AQ9UN37 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms