Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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