Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DKK4Q9UBT3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms