Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP35Q9P2H5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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