Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A1Q9NY26 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms