Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMC2Q9NRP2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms