Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms