Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE7BQ9NP56 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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