Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms