Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1EQ9GZS1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms