Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms