Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF17Q9BXT8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms