Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms