Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms