Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LPIN3Q9BQK8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms