Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms