Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms