Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SENP8Q96LD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms