Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHAMP1Q96JM3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms