Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms