Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXRED1Q96CU9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms