Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms