Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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UBXN4Q92575 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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