Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDND2Q8NHS1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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