Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms