Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms