Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF548Q8NEK5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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