Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms