Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms