Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDZD4Q76G19 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms