Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms