Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms