Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms