Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM225Q6GV28 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms