Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNS3Q68CZ2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNS3Q68CZ2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms