Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms