Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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