Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms