Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKDCCQ504Y2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms