Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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