Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PROX2Q3B8N5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms