Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VWC2Q2TAL6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VWC2Q2TAL6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms